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Dans un rapport publié le 22 novembre portant sur l’évaluation de la feuille de route de maîtrise de l’antibiorésistance, adoptée en 2016, et l’élaboration de la future feuille de route, six inspections ministérielles (dont le CGAAER - ministère de l'Agriculture) préconisent, entre autres recommandations, d’étudier le risque de transmission de l’antibiorésistance dans l’industrie agroalimentaire et en santé végétale. Le rapport ajoute qu’il faudra «prévoir le cas échéant des mesures adaptées pour maîtriser le risque». La mission identifie l’agroalimentaire, la santé végétale et l’aquaculture comme de nouveaux éléments de risque à prendre en compte pour la maîtrise de l’antibiorésistance. «Le risque lié à l’utilisation d’antibiotiques en santé végétale reste à expertiser, ces pratiques étant observées dans plusieurs pays pour protéger certaines cultures (riz, agrumes, tomates, paprika), souligne le rapport. L’utilisation de quantités importantes d’antibiotiques pulvérisées en milieu ouvert sur les cultures interroge sur les risques de dissémination d’antibiorésistance». La mission recommande que la nouvelle feuille de route soit adossée à une gouvernance interministérielle et plaide pour des moyens humains et budgétaires renforcés.