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Comme prévu par le nouveau Plan loup, le ministère de la Transition écologique a mis en consultation, jusqu’au 27 mars, un projet d’arrêté «relatif à la méthode d’estimation de la population de loups». Le texte prévoit que l’effectif annuel de loups – dont 19% au maximum peuvent être abattus – sera calculé uniquement par la méthode CMR («capture, marquage, recapture»), basée sur les analyses génétiques des prélèvements réalisés par l’OFB. L’estimation de la population lupine sera publiée une fois par an «en fin d’année, soit «quelques mois après le recueil en période hivernale des échantillons analysés». À titre transitoire, le plafond de tir 2024 sera fixé à partir de la population définitive de 2023, dont l’estimation sortira à la mi-mars. Après quoi l’effectif 2024 sera publié en fin d’année, afin de fixer le plafond de tirs pour 2025. L’effectif de loups était jusque-là calculé par la méthode CMR, mais aussi par la méthode EMR («effectif minimum retenu de loups»), qui prend en compte les «observations visuelles ou les comptages d'empreintes», sans analyse génétique. L’utilisation de ces deux méthodes donnait donc lieu à deux communications dans l’année, sources de confusion: 906 loups en juillet 2023, 1104 en septembre. Le Groupe national loup a donc décidé de ne conserver que la méthode CMR, «reconnue comme la plus fiable scientifiquement», selon le ministère.