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Les sujets privilégiés par les deux appels d’offres portent sur la chaîne alimentaire dans sa totalité ; l’épidémiologie des affections liées à l’alimentation et des allergies ; l’impact de l’alimentation sur la santé ; les procédés de traçabilité tout au long de la chaîne de production ; les méthodes d’analyse, de détection et de contrôle ; les méthodes et technologies de production plus sûres et respectueuses de l’environnement et pour des aliments plus sains ; l’incidence pour la santé humaine des produits destinés à l’alimentation animale ; les risques environnementaux pour la santé ; ainsi que d’autres actions spécifiques. Mais pour chacune de ces thématiques générales, la Commission propose des sujets d’études très précis. C’est par exemple le cas pour les projets couvrant « la chaîne alimentaire dans sa totalité ». Deux programmes de recherches sont envisagés. L’un pour « l’amélioration de la qualité et de la sûreté de la viande bovine et des produits à base de viande bovine pour le consommateur au niveau de la production » ; l’autre pour « l’amélioration de la qualité et de la sûreté des produits à base de volaille pour le consommateur ».