Après plusieurs mois de circulation chez les bovins, les autorités viennent d’annoncer le premier cas humain au monde de contamination par le virus Shamonda, en France. Le patient concerné, décédé début octobre, souffrait d’une « pathologie grave » et d’une « immunodépression sévère ».
Pour la première fois au monde, le virus Shamonda, qui infectait alors uniquement les ruminants, a été détecté chez l’être humain, en France, ont annoncé les ministères de la Santé et de l’Agriculture le 22 octobre. Le virus a été confirmé chez « un patient présentant une immunodépression sévère, pris en charge aux Hospices civils de Lyon pour une pathologie grave », décédé « début octobre », d’après un communiqué. Ce patient montrait des « complications cérébrales », qui seraient « très probablement liées à l’infection par le virus Shamonda ». Selon Le Progrès, il s’agirait d’un homme d’une soixantaine d’années, originaire de l’Ain. Des informations qui n’ont pas été confirmées par les pouvoirs publics. Le virus a été détecté au cours d’une analyse métagénomique (analyse de tous les fragments d’ADN et d’ARN d’un échantillon).
En raison du profil médical du patient, il s’agit « d’un cas exceptionnel », insiste le gouvernement. Il s’agit en effet de « la première détection documentée et rapportée du virus chez l’être humain ». Une telle transmission n’avait jamais été documentée, malgré « plusieurs décennies de circulation du virus Shamonda en Afrique et en Asie » (le virus a été décrit pour la première fois au Nigeria dans les années soixante). Ce pathogène du genre orthobunyavirus était « jusqu’à présent considéré comme non transmissible à l’être humain », rappelle le gouvernement.
« Ni vigilance ni crise »
Malgré ce cas exceptionnel, « il n’y a pas pour le moment ni vigilance ni crise sanitaire », a indiqué le ministère de la Santé lors d’un brief à la presse le 22 octobre. Selon le communiqué gouvernemental, « au regard des connaissances disponibles sur ce virus, aucun risque sanitaire pour la population générale n’est identifié à ce jour » (y compris chez les personnes immunodéprimées). « Le patient n’était pas éleveur et n’avait pas de lien immédiat avec des bovins dans son entourage proche », a précisé le ministère de la Santé. Et d’ajouter : « Il n’y a aucun élément épidémiologique qui laisserait penser que le virus passe de l’animal à l’humain, ni d’un humain à un autre humain. » En particulier, les autorités n’ont observé aucune nouvelle mutation du virus. Par ailleurs, sur son site internet, le ministère de l’Agriculture réfute tout risque de contamination humaine par « la consommation de viande, de lait ou de produits dérivés ». Par ailleurs, « les produits issus des animaux malades sont toujours exclus de la consommation », rappelle la Rue de Varenne.
Concernant le cas de Lyon, des investigations « cliniques, biologiques et épidémiologiques » sont encore en cours, ajoutent les ministères. À ce stade, « l’hypothèse est celle d’une contamination vectorielle du cas, par la piqûre d’un moucheron de type Culicoïde », le même qui diffuse la maladie chez les ruminants. C’est dans l’est de la France que le virus est apparu cet été, avant de se diffuser ailleurs.
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« Plusieurs années » d’immunité chez les bovins
Dans les élevages bovins, après plusieurs semaines de propagation, « on va sous doute arriver à la fin de la vague d’ici quelques semaines », a estimé Jean-Luc-Guérin, professeur à l’École nationale vétérinaire de Toulouse (ENVT), intervenant lors du brief gouvernemental. Alors que le virus est présent dans 54 départements, selon la plateforme ESA, « on peut supposer que l’ensemble du territoire est en train de faire son infection », à la suite de quoi « une grande partie des troupeaux seront séropositifs ». Or, l’infection confère « une très bonne immunité, qui peut durer plusieurs années », explique Gilles Salvat, directeur général délégué à l’Anses. Une déduction faite « par analogie avec le virus de Schmallenberg », proche de Shamonda.
Par ailleurs, le mode de diffusion de la maladie laisse aussi espérer une pause hivernale. Le virus Shamonda est véhiculé par les moucherons Culicoïdes ; ces insectes transmettent aussi la fièvre catarrhale ovine (FCO) et la maladie hémorragique épizootique (MHE). « Les contaminations dureront jusqu’à ce qu’il n’y ait plus de culicoïdes, indique M Salvat. Généralement, elles s’arrêtent fin septembre, début octobre. Mais, quand il y a une arrière-saison très chaude, elles peuvent durer jusqu’à novembre ».
Troubles neurologiques chez les ovins et équins
Le virus Shamonda-Europe, qui constitue une nouvelle souche d’orthobunyavirus, est apparu cet été dans l’est de la France, en Allemagne et en Suisse. Il a infecté principalement des bovins, avec un impact sanitaire « jugé faible dans les élevages touchés », rappelle le ministère de l’Agriculture. Les symptômes (fièvre, diarrhée, baisse de la production laitière) disparaissent rapidement. Mais « il peut y avoir un effet retard chez les vaches gestantes », prévient Jean-Luc Guérin, avec des possibilités d’avortement, de malformations ou de mortinatalités. D’autres espèces ont été touchées : des ovins et des équins, avec notamment des troubles neurologiques.
YG