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Afin de réduire les émissions de gaz à effet de serre liées au transport de marchandises, le CGEDD (ministère de la Transition écologique) et le CGAAER (ministère de l'Agriculture) recommandent, dans un rapport publié le 16 février, de développer les flux logistiques de marchandises agricoles et alimentaires par voie ferroviaire et fluviale. La logistique représente environ 15% de l’empreinte carbone des activités des industries agricoles et agroalimentaires. Les services ministériels estiment que le doublement du fret ferroviaire et la hausse de 30% du fret fluvial pourraient permettre de réduire de 39% les émissions de gaz à effet de serre liées aux flux de transports de l’agroalimentaire d’ici 2030. Pour atteindre ce niveau, il faudra également «décarboner» le parc de poids lourds, optimiser les charges transportées et limiter la croissance des flux de transport à 0,5% par an. Afin de favoriser le recours aux trains, le rapport insiste sur la priorité à donner à «la rénovation des capillaires» et propose d’expérimenter sur certaines lignes de fret des contrats entre l’État, la SNCF et les chargeurs, garantissant un certain niveau de service.