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La technologie Crispr pourrait aider à réduire les émissions de méthane des bovins
Un vaste projet de recherche vient d’être lancé par l’Innovative Genomics Institute en collaboration avec plusieurs campus de l’université de Californie. Les chercheurs espèrent réduire les émissions de méthane du bétail en modifiant le génome de leur microbiote intestinal.
Le méthane émis par les vaches, source importante de gaz à effet de serre, provient de microbes producteurs de gaz dans l'intestin. Modifier des microbes pour qu'ils produisent moins de méthane aiderait à limiter les émissions de GES et aurait donc un impact favorable sur l’environnement.
C’est le but d’un vaste projet de recherche porté par l’Innovative Genomics Institute (IGI), basé à l’université de Californie à Berkeley, en collaboration avec des chercheurs de l'université de Californie à San Francisco (UC San Francisco) et de l'université de Californie à Davis (UC Davis). Fondé en 2014 par la biochimiste lauréate du prix Nobel de chimie Jennifer Doudna, l’IGI a codéveloppé le système de modification du génome CRISPR-Cas9, aussi appelé « ciseau génétique ».
Prévu pour durer sept ans, ce projet prévoit d'éditer les génomes des communautés microbiennes complexes, appelées des microbiomes, comme solution à des problèmes de santé et de climat. Alors que les chercheurs de l’UC San Francisco se pencheront sur les moyens d’aider à prévenir et à traiter l'asthme chez les enfants, les chercheurs de l’UC Davis Ermias Kebreab et Matthias Hess travailleront sur la réduction d’émission de méthane par le bétail.
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Arriver à un traitement oral pour les veaux
« Nous essayons de trouver une solution pour réduire le méthane qui soit facilement accessible et peu coûteuse, sans restriction et qui puisse être mise à la disposition non seulement de la Californie mais aussi du monde entier », explique Matthias Hess, professeur adjoint en microbiologie à UC Davis. Son collègue Ermias Kebreab est connu pour ses recherches innovantes utilisant des additifs alimentaires, et notamment les algues rouges, pour réduire les émissions de méthane des vaches laitières jusqu’à 82%. Utiliser la technologie Crispr-Cas 9 permet d’apporter des modifications très ciblées à des gènes spécifiques dans des microbes précis.
« L'ingénierie des microbes directement là où ils vivent, sans qu'il soit nécessaire de les isoler, n'a pas encore été réalisée car il n'existe aucun outil pour le faire », souligne Ermias Kebreab. « Maintenant, avec UC Berkeley, nous allons développer ces outils. » Durant ce projet, Matthias Hess testera les outils microbiens et les stratégies de bioconfinement développés à l'IGI en laboratoire, puis il livrera les découvertes et les résultats à Ermias Kebreab pour les appliquer aux animaux sur le terrain. Les deux chercheurs espèrent un jour fournir des traitements oraux aux veaux « pour intervenir dans leurs systèmes microbiens à un stade précoce et réduire les émissions de méthane pour le reste de leur vie », explique l’université dans son communiqué du 17 avril 2023. À terme, cela pourrait même devenir une pratique mondiale.