Le patrimoine génétique du vanillier découvert à 83%

Près de 98% de la vanille commercialisée dans le monde est issue d’une seule espèce, la Vanilla planifolia. Et cette faible diversité génétique fragilise la filière. Mais après quatre ans de recherche et de travail conjoint d’instituts privés (Eurovanille et V. Mane Fils) et d’instituts publics (Cirad, l’Université de La Réunion, Inrae, le CNRS, l’Université Paris-Saclay, et l’Etablissement Vanille de Tahiti), 83% du génome de Vanilla planifolia a enfin pu être séquencé. La difficulté de cette opération est due à une caractéristique de son génome : l’endoréplication partielle, créant une asymétrie de l’information génétique. Concrètement, certaines parties du génome sont plus répliquées que d’autres complexifiant le séquençage du génome. « Chez Vanilla planifolia, la partie non répliquée représente 72% de l’ADN ! Cette partie du génome se retrouve donc très minoritaire dans le noyau et difficilement accessible par les outils de séquençage » explique Quentin Piet, doctorant en génomique au Cirad et à l’Université de La Réunion, premier auteur de l’étude, cité dans un communiqué de l’Inrae publié le 6 mai 2022. Afin de faciliter le séquençage, les cellules avec le moins de réplication sont étudiées.

Cette meilleure connaissance du génome va permettre d’accélérer la sélection variétale de vanilliers. En effet, « pour sélectionner une nouvelle variété de vanilliers à partir de graines, il faut compter sept à huit ans par génération » souligne Michel Grisoni, chercheur au Cirad et co-auteur de l’étude. Grâce au séquençage du génome, les délais peuvent être réduits. De plus, la sélection peut permettre une meilleure résistance aux maladies et « un vanillier plus vigoureux, plus résistant et plus productif, est d’un intérêt majeur pour notre industrie car pouvant avoir un impact significatif sur la qualité et le prix des gousses produites » expliquent conjointement Laurent Bourgois, président de la société Eurovanille et Joseph Zucca, du groupe V. Mane Fils (parfums et arômes).