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L’Agence bio commence à donner des éléments concernant les atouts de l’agriculture biologique. Première observation : ce type de production maintient des sols vivants et fertiles. Des études menées en Suisse montrent que les sols bio contiennent 20 % à 30 % de biomasse microbienne en plus, 30% à 40% de vers de terre en plus, 90% d’araignées en plus et 40% de mycorhizes en plus en colonisation racinaire, avec tous les bénéfices induits pour la nutrition des plantes et la protection phytosanitaire.
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Sur le plan environnemental, l’exemple de la ville de Munich montre que l’agriculture biologique contribue à la qualité de l’eau. Sur une zone de 6000 ha dont 2250 ha autour de la zone de captage de l’eau de la ville, les agriculteurs ont été invités à se convertir à l’agriculture biologique à partir de 1994. La conversion s’est faite progressivement. « La qualité des eaux s’est améliorée avec une diminution des teneurs en nitrates de 15 mg/l en 1991 à 6,3 mg/l en 2005 et une absence totale de traces de résidus de pesticides alors qu’ils étaient de 0,065 mg/l en 1991 », écrit l’Agence bio.