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A côté des formats classiques de discussions, les députés européens se rassemblent aussi de manière informelle autour d’une série de thématiques précises sous la forme d’« intergroupes ». Un type de regroupements volontaires qui transcendent les partis politiques et peuvent avoir une influence non négligeable sur les décisions européennes.
23 intergroupes sont officiellement enregistrés au Parlement européen et le nombre d’intergroupes ne cesse d’augmenter au fil des ans à mesure que les intérêts des députés européens s’étendent à de nouveaux domaines. La Protection des Indications Géographiques, les négociations au sein de l’OMC, la fiscalité, la promotion commerciale, l’alimentation et santé, les OGMs etc., sont quelques-uns des dossiers qui sont traités durant les réunions de ces intergroupes, lesquelles ont lieu tous les deux mois à Strasbourg. Cependant, si les intergroupes varient en taille et en thématiques abordées, ils varient également en type d’organisation : certains sont basés au sein du PE et assistés parfois par les groupes politiques, d’autres ont un secrétariat externe pour le soutien administratif et logistique, financé par une industrie ou une ONG. Soucieux d’éviter tout manque de transparence, le Parlement a pris soin d’encadrer les intergroupes en prévoyant que tout président d’intergroupe soit obligé de déclarer tout soutien qu’il reçoit, financier ou autre.