Le risque n’est pas avéré, mais la question se pose : la méthanisation a-t-elle un avenir dans le mix énergétique du pays face à d’autres énergies renouvelables ? Face aux discussions bruxelloises sur le sujet, le Syndicat des énergies renouvelables (SER) a souligné, le 14 avril, lors d'une conférence de presse, « l’incohérence » d’une éventuelle mise en concurrence. « Mettre en concurrence de l’éolien offshore avec un méthaniseur… je ne vois pas comment on peut l’organiser », a déploré Jean-Louis Bal, président du Syndicat des énergies renouvelables. De fait, des appels d’offres à neutralité technologique sont « envisagés » dans les discussions rapportées entre la DG Concurrence et la DG Énergie de la Commission européenne. L’idée est de mettre en concurrence les énergies renouvelables entre elles à partir du 1er janvier 2017. Plus précisément, les appels d’offres, levier puissant de développement des énergies renouvelables, ne porteraient plus uniquement, par exemple, sur la méthanisation. Cette technologie serait mise en concurrence avec l’éolien offshore et la géothermie. En outre, le projet serait d’un côté de mettre en concurrence entre elles les énergies renouvelables dites matures (éolien terrestre, photovoltaïque, hydroélectricité) et de l’autre, celles dites non matures (biomasse liquide, biomasse gazeuse, éolien offshore, géothermie).
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« C’est inapproprié. On ne peut pas résumer le développement des énergies renouvelables au seul prix du kilowattheure », s’inquiète Jean-Louis Bal. Pour le volet biomasse, Sabrine Fuseliez, responsable du département bioénergie au Syndicat des énergies renouvelables, rappelle que les méthaniseurs agricoles individuels « à ce stade, ne sont pas concernés. » De fait, les appels d’offres concernés ne seraient que les « gros » projets supérieurs à un mégawattheure. Mais Sabrine Fuseliez souligne : « Les projets globaux de territoire qui dépassent le mégawattheure seraient concernés ». Or, ces projets misent sur des approvisionnements entre autres agricoles et agroalimentaires des digesteurs.