Les représentants de la Coordination rurale ont rencontré le ministre de l'Agriculture Marc Fesneau au Sommet de l’élevage pour lui demander un «accompagnement financier afin de compenser les impacts sanitaires de la maladie», apprend-on dans un communiqué le 4 octobre. Le deuxième syndicat agricole estime que ces effets «peuvent être importants dans les troupeaux foyers», occasionnant des frais vétérinaires «de l'ordre de 250 € par animal, et pouvant atteindre 600 €, sans compter les animaux morts». S’y ajouteraient, selon la CR, de «probables effets sur la reproduction (avortement, baisse de la fertilité, momification, etc.)». Le syndicat a aussi demandé au ministre «la mise en place des années blanches pour les éleveurs [touchés] par la MHE», ainsi que «la prise en charge des analyses nécessaires à la sortie des animaux de la zone réglementée». Depuis le 1er octobre, les animaux doivent subir un test PCR pour pouvoir sortir de la zone réglementée (150 km autour des foyers). Au 29 septembre, la France comptait 19 cas en tout, dans les Pyrénées-Atlantiques et les Hautes-Pyrénées. Concernant l'export, Marc Fesneau a annoncé le 3 octobre la réouverture de l'Espagne pour les envois de bovins vivants, tout en ayant «bon espoir» de débloquer l'Italie dans les heures ou les jours qui viennent».
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